南京农业大学建有“中国菊花种质资源保存中心”，共收集保存菊花品种3000余个、资源5000余份，保存数量居世界首位。先后承担国家及省部级课题80余项，选育不同用途系列新品种300余个，申请国家发明专利50项，国家植物新品种权38个，20个品种通过江苏省农作物新品种鉴定（审定）。近年来获省部级一等奖两项、二等奖三项，国家科技进步二等奖一项（第三完成单位），同时还获得世界园艺博览会金奖、华耐园艺科技奖等行业奖。1人入选国家杰青，1人入选教育部长江学者特聘教授，1人入选科技部中青年科技创新领军人才，1人入选农业部农业科研杰出人才，研究团队入选农业部和江苏省创新团队，在菊花种质资源搜集、保存和新品种选育及菊花高效栽培等研究领域有明显优势。
目前拥有菊花资源保存与育种基地300亩，其中智能玻璃温室30000 m2、连栋薄膜温室40000 m2，配套齐全。育成了系列绿色、双色、乒乓型、托桂型等切花菊新品种，自然成球性盆栽多头小菊，匍匐型地被菊，食用菊、茶用菊新品种，新品种相继获得了世界园艺博览会——国际菊花竞赛展金奖，全国及行业内多项奖励，并已在江苏、云南、上海等10多个省（市）推广应用，创造了显著效益，成果应用还带动了休闲旅游农业发展，仅2014年我校基地参观人数就超过90万人次。
切花菊新品种选育
盆栽多头菊新品种
茶用菊新品种
